區別在于，雖然同樣是通過一個程序連接到服務器進行網絡通訊，但是bs結構的，客戶端運行在瀏覽器里，比如你看百度，就是通過瀏覽器。還有一些bs結構的應用，比如中國電信，以及一些電子商務平臺。用bs結構的好處是，不必專門開發一個客戶端界面，可用asp,php,jsp等比較快速開發web應用的程序開發。
cs結構的，要做一個客戶端。網絡游戲基本上大多是cs結構，比如你玩傳奇，要專門開個傳奇程序;玩冒險島，要專門開個冒險島……
cs結構的優點是可以定做很多外觀，可以做很多安全措施，可以補充瀏覽器沒有的功能。缺點是開發速度比較慢，一個功能比較完善的客戶端比較難做。
專業理論上又是這么解釋的……
C/S又稱Client/Server或客戶/服務器模式。服務器通常采用高性能的PC、工作站或小型機，并采用大型數據庫系統，如Oracle、Sybase、Informix或 SQL Server。客戶端需要安裝專用的客戶端軟件。
B/S是Brower/Server的縮寫，客戶機上只要安裝一個瀏覽器（Browser），如Netscape Navigator或Internet Explorer，服務器安裝Oracle、Sybase、Informix或 SQL Server等數據庫。瀏覽器通過Web Server 同數據庫進行數據交互。
C/S的優點是能充分發揮客戶端PC的處理能力，很多工作可以在客戶端處理后再提交給服務器。對應的優點就是客戶端響應速度快。缺點主要有以下幾個：
只適用于局域網。而隨著互聯網的飛速發展，移動辦公和分布式辦公越來越普及，這需要我們的系統具有擴展性。這種方式遠程訪問需要專門的技術，同時要對系統進行專門的設計來處理分布式的數據。
客戶端需要安裝專用的客戶端軟件。首先涉及到安裝的工作量，其次任何一臺電腦出問題，如病毒、硬件損壞，都需要進行安裝或維護。特別是有很多分部或專賣店的情況，不是工作量的問題，而是路程的問題。還有，系統軟件升級時，每一臺客戶機需要重新安裝，其維護和升級成本非常高。
對客戶端的操作系統一般也會有限制。可能適應于Win98, 但不能用于win2000或Windows XP。或者不適用于微軟新的操作系統等等，更不用說Linux、Unix等。
B/S最大的優點就是可以在任何地方進行操作而不用安裝任何專門的軟件。只要有一臺能上網的電腦就能使用，客戶端零維護。系統的擴展非常容易，只要能上網，再由系統管理員分配一個用戶名和密碼，就可以使用了。甚至可以在線申請，通過公司內部的安全認證（如CA證書）后，不需要人的參與，系統可以自動分配給用戶一個賬號進入系統
